Koç Üniversitesi İşletme Enstitüsü Executive MBA ve MBA programları lisansüstü işletme eğitiminin önde gelen otoritesi AMBA (The Association of MBAs) tarafından akredite edilmiştir. AMBA akreditasyonu sadece en iyi lisansüstü işletme programlarına verilmektedir. Akreditasyon işletme yüksek lisans eğitim programlarında ulaşılabilecek en yüksek standartları temsil etmektedir. Koç Üniversitesi Türkiye’deki AMBA akreditasyonuna sahip ilk kuruluş olup, dünya çapında ise 239. sırada yer almaktadır. AMBA akreditasyonu ile Koç Üniversitesi İşletme Enstitüsü dünyanın en elit işletme okullarının %2’sinin arasına katılmış bulunmaktadır.